หลังจากผู้บริหารสายการบินบางกอกแอร์เวย์ เสนอแนะ คสช. ควบรวมกิจการ "การบินไทย" กับ "ทอท." เพื่อลดการขาดทุนสะสม สร้างความไม่พอใจให้พนักงานการบินไทยบางส่วน และเรียกร้องผู้บริหารบางกอกแอร์เวย์ แสดงความรับผิดชอบเรื่องนี้

กรณีที่ นายแพทย์ปราเสริฐ ปราสาททองโอสถ ประธานเจ้าหน้าที่บริหาร สายการบิน บางกอกแอร์เวย์ส กล่าวว่า   ที่ผ่านมายังไม่มีการแก้ปัญหาการขาดทุนของการบินไทยได้ตรงจุด นอกจากการฟื้นฟูกิจการ ตนเองจึงได้เสนอแนะให้ คสช. ควบรวมกิจการของการบินไทย กับ บริษัท ท่าอากาศยานไทย จำกัด (มหาชน) หรือ ทอท.  เนื่องจาก ทั้งสองหน่วยงาน มีรัฐถือหุ้นเกิน 70%  หากไม่ดำเนินการ อาจทำให้การบินไทยต้องหยุดทำการบิน  

เมื่อควบรวมกิจการ จะทำให้พนักงานการบินไทย มาทำงานกับ ทอท.มากขึ้น เนื่องจาก ทอท.มีการจ่ายเงินโบนัสพนักงานล่าสุดที่ 8 เดือน ซึ่งจะทำให้พนักงานการบินไทยที่มีความเครียดจากการไม่ได้รับโบนัส  

กรณีดังกล่าว สร้างความไม่พอใจให้พนักงานการบินไทยบางส่วน เนื่องจากเป็นการตำหนิการทำงานของพนักงานการบินไทย  ที่เป็นพนักงานส่วนน้อยของการบินไทย พนักงานบางส่วนจึงยื่นหนังสือ ขอให้ นายแพทย์ปราเสริฐ ให้ออกมาแสดงความรับผิดชอบต่อคำสัมภาษณ์ดังกล่าว หากไม่มีผลตอบรับภายใน 48 ชั่วโมง   พนักงานการบินไทยจะนำพวงหรีดขนาดใหญ่สีดำไปวางให้นายแพทย์ปราเสริฐ เพื่อแสดงออกถึงความไม่พอใจดังกล่าว 

ทั้งนี้  ธนาคารออมสินได้ปฏิเสธการเงินกู้ให้กับการบินไทย  เนื่องจากบอร์ดไม่เห็นชอบแผนฟื้นฟูกิจการ จากนั้น ที่ประชุมคณะรัฐมนตรี  จึงมีมติให้กระทรวงการคลังปล่อยเงินกู้ 20,000 ล้านบาทแทน  

ในปี 2552 นายแพทย์ปราเสริฐ เคยเสนอแนะให้รัฐบาลในขณะนั้น แปรรูปการบินไทย ซึ่งเป็นรัฐวิสาหกิจ ให้เป็นหน่วยงานเอกชน  ผ่านการลดการถือหุ้นของกระทรวงการคลัง จากเดิม 51%  ให้เหลือ 30%